雅典耀大学始建于1859年10月1日，是一所由基督教的西班牙牧师们建立的，以西班牙后裔为对象的私立小学。

　　1912年，美国耶稣会接管了雅典耀。

　　1965年，新增加一个科系ART(人文科系)，后更名为“Ateneo Municipal de Manila”，有教授音乐及艺术等，增加一些专业技术之课程，例如：农业、商业等。

　　19世纪初，美国政权给Ateneo带来了一些改变。

　　1921年，美国纽约之耶稣教会取代了西班牙耶稣教会在Ateneo的主导权。

　　1932年，校址迁移至Padre Faura. Ermita